Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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