Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms