Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms