Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms