Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Trim12aQ99PQ1 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Trim12aQ99PQ1 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Trim12aQ99PQ1 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Trim12aQ99PQ1 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Trim12aQ99PQ1 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim12aQ99PQ1 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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