Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CipcQ8R0W1 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms