Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rab11fip3Q8CHD8 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms