Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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