Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim47Q8C0E3 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim47Q8C0E3 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim47Q8C0E3 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim47Q8C0E3 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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