Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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