Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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