Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms