Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cpne9Q1RLL3 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms