Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms