Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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