Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms