Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RxraP28700 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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RxraP28700 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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