Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Pde6aP27664 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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