Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpraP18052 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpraP18052 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpraP18052 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms