Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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