Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P01649 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P01649 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms