Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Srp54bE9PXC0 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms