Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms