Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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