Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Swt1Q9DBQ9 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Swt1Q9DBQ9 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Swt1Q9DBQ9 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Swt1Q9DBQ9 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Swt1Q9DBQ9 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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