Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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