Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms