Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ubash3bQ8BGG7 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms