Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256 ms