Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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