Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp39Q3TIX9 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms