Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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