Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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