Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LmnaP48678 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms