Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms