Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms