Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Gm20939L7N243 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Gm20939L7N243 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms