Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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