Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms