Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 3600.7 ms