Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms