Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms