Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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