Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NubplQ9CWD8 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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