Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Rprd1bQ9CSU0 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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Rprd1bQ9CSU0 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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Rprd1bQ9CSU0 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Rprd1bQ9CSU0 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
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Rprd1bQ9CSU0 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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