Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp16Q99LG0 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms