Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms