Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp27Q8CEG8 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Usp27Q8CEG8 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms