Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NischQ80TM9 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NischQ80TM9 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms