Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NipblQ6KCD5 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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